Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE4AQ14139 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE4AQ14139 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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