Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCINQ13939 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCINQ13939 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCINQ13939 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCINQ13939 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCINQ13939 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCINQ13939 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCINQ13939 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCINQ13939 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCINQ13939 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCINQ13939 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCINQ13939 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCINQ13939 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCINQ13939 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCINQ13939 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCINQ13939 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCINQ13939 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCINQ13939 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCINQ13939 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCINQ13939 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCINQ13939 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCINQ13939 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCINQ13939 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCINQ13939 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCINQ13939 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCINQ13939 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCINQ13939 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCINQ13939 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCINQ13939 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCINQ13939 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCINQ13939 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCINQ13939 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCINQ13939 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCINQ13939 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCINQ13939 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCINQ13939 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCINQ13939 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCINQ13939 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCINQ13939 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCINQ13939 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCINQ13939 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCINQ13939 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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