Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRQ13535 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRQ13535 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRQ13535 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRQ13535 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRQ13535 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRQ13535 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRQ13535 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRQ13535 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRQ13535 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRQ13535 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRQ13535 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRQ13535 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRQ13535 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRQ13535 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRQ13535 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRQ13535 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRQ13535 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRQ13535 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRQ13535 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATRQ13535 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATRQ13535 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRQ13535 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRQ13535 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRQ13535 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRQ13535 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRQ13535 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRQ13535 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRQ13535 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATRQ13535 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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