Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC3Q13507 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC3Q13507 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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