Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA4Q13439 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA4Q13439 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA4Q13439 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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