Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AP3B2Q13367 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AP3B2Q13367 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B2Q13367 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B2Q13367 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms