Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP140Q13342 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP140Q13342 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP140Q13342 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP140Q13342 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP140Q13342 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SP140Q13342 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SP140Q13342 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP140Q13342 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP140Q13342 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140Q13342 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140Q13342 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140Q13342 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140Q13342 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140Q13342 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP140Q13342 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP140Q13342 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140Q13342 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140Q13342 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140Q13342 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP140Q13342 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP140Q13342 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP140Q13342 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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SP140Q13342 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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SP140Q13342 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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SP140Q13342 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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SP140Q13342 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140Q13342 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP140Q13342 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP140Q13342 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP140Q13342 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140Q13342 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP140Q13342 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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