Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN3Q13286 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN3Q13286 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN3Q13286 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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