Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRPL28Q13084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRPL28Q13084 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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