Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN31Q12999 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN31Q12999 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN31Q12999 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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