Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFSWAPQ12872 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFSWAPQ12872 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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