Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB40BQ12829 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RAB40BQ12829 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RAB40BQ12829 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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