Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ARHGEF5Q12774 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ARHGEF5Q12774 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARHGEF5Q12774 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF5Q12774 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF5Q12774 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF5Q12774 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF5Q12774 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF5Q12774 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF5Q12774 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms