Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SKN1YGR143W 2316 nt5.97□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 SUB2YDL084W 1341 nt5.97□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 CDC19YAL038W 1503 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YCL065WYCL065W 369 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YEA6YEL006W 1008 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YER186CYER186C 921 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 REV7YIL139C 738 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 PAN6YIL145C 930 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 STM1YLR150W 822 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 ORC5YNL261W 1440 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 VPS4YPR173C 1314 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 CLB2YPR119W 1476 nt5.96□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 PRP46YPL151C 1356 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 MSS116YDR194C 1995 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 HSP78YDR258C 2436 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 DON1YDR273W 1098 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 SET5YHR207C 1581 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 MRP17YKL003C 396 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 MTC2YKL098W 1074 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 LST8YNL006W 912 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 CSG2YBR036C 1233 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 RPN7YPR108W 1290 nt5.95□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 BNA5YLR231C 1362 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YER010CYER010C 705 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 KSS1YGR040W 1107 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 RPR2YIR015W 435 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YBR124WYBR124W 360 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 AVO1YOL078W 3531 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 SHM1YBR263W 1473 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 VPS5YOR069W 2028 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 TKL1YPR074C 2043 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 PYC1YGL062W 3537 nt5.94□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 GPT2YKR067W 2232 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YGR022CYGR022C 330 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 CBP4YGR174C 513 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YKL031WYKL031W 414 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 RPL10YLR075W 666 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 SCO2YBR024W 906 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 AMA1YGR225W 1782 nt5.93□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 UTP9YHR196W 1728 nt5.92□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 ARR3YPR201W 1215 nt5.92□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 PTK2YJR059W 2457 nt5.92□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YMR155WYMR155W 1644 nt5.92□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 PAP1YKR002W 1707 nt5.91□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YDR154CYDR154C 351 nt5.91□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 JJJ3YJR097W 519 nt5.91□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 CWC27YPL064C 906 nt5.91□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 YME1YPR024W 2244 nt5.91□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 VPS72YDR485C 2388 nt5.91□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 DCN1YLR128W 810 nt5.9□□□□□ -1.46
VPS54Q12071 MCM6YGL201C 3054 nt5.9□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 VNX1YNL321W 2727 nt5.9□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 ALD6YPL061W 1503 nt5.89□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YFL042CYFL042C 2025 nt5.89□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 DPB2YPR175W 2070 nt5.89□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 GEX1YCL073C 1848 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 MLC2YPR188C 492 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YEH1YLL012W 1722 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 ADY2YCR010C 852 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 RHB1YCR027C 630 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 RSC30YHR056C 2652 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YNL247WYNL247W 2304 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 SSK1YLR006C 2139 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 HIR1YBL008W 2523 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 EFM4YIL064W 774 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 COX17YLL009C 210 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YNL108CYNL108C 813 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 MRPL36YBR122C 534 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 TEL2YGR099W 2067 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 HSP104YLL026W 2727 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 GUP2YPL189W 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 CNM67YNL225C 1746 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 SMF2YHR050W 1650 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 MKK2YPL140C 1521 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 ARO10YDR380W 1908 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 AIM17YHL021C 1398 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 GEX2YKR106W 1848 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YDL057WYDL057W 987 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 RPL7AYGL076C 735 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 HCR1YLR192C 798 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 GFD1YMR255W 567 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 RPL7BYPL198W 735 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 ECM2YBR065C 1095 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS54Q12071 YJU2YKL095W 837 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 FAT3YKL187C 2253 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 BUL1YMR275C 2931 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 GUA1YMR217W 1578 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 ARG1YOL058W 1263 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 RBD2YPL246C 789 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 PDB1YBR221C 1101 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 APM4YOL062C 1476 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 HOS1YPR068C 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 MID1YNL291C 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 QDR3YBR043C 2070 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 STE13YOR219C 2796 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS54Q12071 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.81□□□□□ -1.48
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