Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 YIR042CYIR042C 711 nt6.35□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 GYP8YFL027C 1494 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 SAS4YDR181C 1446 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 BRL1YHR036W 1416 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 KNS1YLL019C 2214 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 RHB1YCR027C 630 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 AAD6YFL056C 639 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 ERP2YAL007C 648 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 SSP120YLR250W 705 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 AIM33YML087C 939 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 PDR18YNR070W 4002 nt6.34□□□□□ -1.39
HFI1Q12060 KKQ8YKL168C 2175 nt6.33□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.33□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.33□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 COA1YIL157C 594 nt6.33□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 MRPL22YNL177C 930 nt6.33□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 ELA1YNL230C 1140 nt6.33□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 CTF18YMR078C 2226 nt6.32□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 PHB1YGR132C 864 nt6.32□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 PPA2YMR267W 933 nt6.32□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 YBR144CYBR144C 315 nt6.32□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.31□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.31□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.31□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 RPO26YPR187W 468 nt6.31□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 IMG2YCR071C 441 nt6.3□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 NCS6YGL211W 1080 nt6.3□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 MSA2YKR077W 1092 nt6.3□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 NDJ1YOL104C 1059 nt6.3□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 VRP1YLR337C 2454 nt6.3□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 SEC18YBR080C 2277 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 snR57snR57 88 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 YGR022CYGR022C 330 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 PAN6YIL145C 930 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 SCP1YOR367W 603 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 FES1YBR101C 873 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 IFA38YBR159W 1044 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 CNE1YAL058W 1509 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 MST1YKL194C 1389 nt6.29□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 YDR278CYDR278C 318 nt6.28□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 VTA1YLR181C 993 nt6.28□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 GFD1YMR255W 567 nt6.28□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 RPN7YPR108W 1290 nt6.28□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 MRPL36YBR122C 534 nt6.28□□□□□ -1.4
HFI1Q12060 TEP1YNL128W 1305 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 ATG32YIL146C 1590 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 IRS4YKR019C 1848 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MCM3YEL032W 2916 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MRPL1YDR116C 858 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YGR066CYGR066C 879 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 DUS4YLR405W 1104 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YOL035CYOL035C 303 nt6.27□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 UPS3YDR185C 540 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MPC1YGL080W 393 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 SUA5YGL169W 1281 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YUR1YJL139C 1287 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 REX3YLR107W 1215 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MTF1YMR228W 1026 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 NMT1YLR195C 1368 nt6.26□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 FRS2YFL022C 1512 nt6.25□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.25□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MRI1YPR118W 1236 nt6.25□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 ARR1YPR199C 885 nt6.25□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 VMA2YBR127C 1554 nt6.25□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 ISC1YER019W 1434 nt6.25□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 SLX5YDL013W 1860 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 SIT1YEL065W 1887 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 TAH18YPR048W 1872 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 AMD1YML035C 2433 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YDL114WYDL114W 927 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 PCL9YDL179W 915 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 EDC1YGL222C 528 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 RRP4YHR069C 1080 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 DJP1YIR004W 1299 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 TPK1YJL164C 1194 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MRP17YKL003C 396 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 URE2YNL229C 1065 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 RPS9AYPL081W 594 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 DHH1YDL160C 1521 nt6.24□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 SRV2YNL138W 1581 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 PRP46YPL151C 1356 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MED2YDL005C 1296 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 HMS2YJR147W 1077 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YBL070CYBL070C 321 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YGP1YNL160W 1065 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YNR040WYNR040W 771 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YPL014WYPL014W 1146 nt6.23□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 SRP101YDR292C 1866 nt6.22□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 APE3YBR286W 1614 nt6.22□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YCL065WYCL065W 369 nt6.22□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YLL017WYLL017W 312 nt6.22□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 MPC54YOR177C 1395 nt6.21□□□□□ -1.41
HFI1Q12060 YML131WYML131W 1098 nt6.21□□□□□ -1.42
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