Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms