Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM27E3Q08E93 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM27E3Q08E93 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms