Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GOLGA3Q08378 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GOLGA3Q08378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
GOLGA3Q08378 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms