Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 PMP3YDR276C 168 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 KSS1YGR040W 1107 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 RPS5YJR123W 678 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 CIN4YMR138W 576 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 CKA2YOR061W 1020 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 PDB1YBR221C 1101 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 RIM101YHL027W 1878 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 NGL2YMR285C 1548 nt4.87□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 SEC18YBR080C 2277 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 ABZ1YNR033W 2364 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 FOB1YDR110W 1701 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YEH1YLL012W 1722 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 UBX2YML013W 1755 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YDL057WYDL057W 987 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 GRX4YER174C 735 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YGL185CYGL185C 1140 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 PHB1YGR132C 864 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 LYS12YIL094C 1116 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 PFA3YNL326C 1011 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 GIT1YCR098C 1557 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 GUA1YMR217W 1578 nt4.86□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 PKC1YBL105C 3456 nt4.85□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 VTC2YFL004W 2487 nt4.85□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YJR085CYJR085C 318 nt4.85□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 SCO2YBR024W 906 nt4.85□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 VNX1YNL321W 2727 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 SOG2YOR353C 2376 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 DEF1YKL054C 2217 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 UBA2YDR390C 1911 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YHL018WYHL018W 363 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 STM1YLR150W 822 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 QRI5YLR204W 336 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt4.84□□□□□ -1.63
HRD1Q08109 PRI2YKL045W 1587 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YMR027WYMR027W 1413 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 BNA5YLR231C 1362 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 PMT2YAL023C 2280 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 GCV3YAL044C 513 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YLR317WYLR317W 435 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 POR1YNL055C 852 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 IMA1YGR287C 1770 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 HXT5YHR096C 1779 nt4.83□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 CTS2YDR371W 1536 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 TRP3YKL211C 1455 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 HOS1YPR068C 1413 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SNZ3YFL059W 897 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YLR463CYLR463C 552 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YML018CYML018C 1182 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SNZ2YNL333W 897 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 MRPS5YBR251W 924 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 PIF1YML061C 2580 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SKS1YPL026C 1509 nt4.82□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YER010CYER010C 705 nt4.81□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 NCS6YGL211W 1080 nt4.81□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 DOT5YIL010W 648 nt4.81□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.81□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 MDY2YOL111C 639 nt4.81□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 APE3YBR286W 1614 nt4.81□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 HSF1YGL073W 2502 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YDR109CYDR109C 2148 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SIP2YGL208W 1248 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SRY1YKL218C 981 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 UBC11YOR339C 471 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 ERI1YPL096C-A 207 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 HIR1YBL008W 2523 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SMF2YHR050W 1650 nt4.8□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 ARP1YHR129C 1155 nt4.79□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YML012C-AYML012C-A 378 nt4.79□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 MLC2YPR188C 492 nt4.79□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 ADE12YNL220W 1302 nt4.78□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 SEC39YLR440C 2130 nt4.78□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 MED6YHR058C 888 nt4.78□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 GFD1YMR255W 567 nt4.78□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.78□□□□□ -1.64
HRD1Q08109 PSE1YMR308C 3270 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 TBF1YPL128C 1689 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 GLE1YDL207W 1617 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 DPH2YKL191W 1605 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 CTR2YHR175W 570 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 HST2YPL015C 1074 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 YBR144CYBR144C 315 nt4.77□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 YML082WYML082W 1950 nt4.76□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 QDR3YBR043C 2070 nt4.76□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 SIT4YDL047W 936 nt4.76□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 NSI1YDR026C 1713 nt4.76□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 ATG7YHR171W 1893 nt4.76□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 RET1YOR207C 3450 nt4.76□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 AMD1YML035C 2433 nt4.75□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 FYV1YDR024W 486 nt4.75□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 YLR184WYLR184W 348 nt4.75□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 PPG1YNR032W 1107 nt4.75□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 ENT2YLR206W 1842 nt4.74□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 WTM2YOR229W 1404 nt4.74□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 FRE3YOR381W 2136 nt4.74□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 YPL062WYPL062W 405 nt4.74□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 ARN2YHL047C 1863 nt4.74□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 MET7YOR241W 1647 nt4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51 ms