Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRB3Q04118 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRB3Q04118 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms