Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAP1Q03518 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAP1Q03518 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms