Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ERCC6Q03468 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ERCC6Q03468 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ERCC6Q03468 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ERCC6Q03468 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ERCC6Q03468 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms