Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF8Q02556 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF8Q02556 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms