Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC1Q01954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms