Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MC1RQ01726 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MC1RQ01726 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms