Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCN7AQ01118 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN7AQ01118 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN7AQ01118 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN7AQ01118 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms