Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDPQ00604 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDPQ00604 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDPQ00604 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDPQ00604 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDPQ00604 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDPQ00604 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDPQ00604 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDPQ00604 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDPQ00604 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDPQ00604 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDPQ00604 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDPQ00604 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDPQ00604 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDPQ00604 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms