Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED6P86452 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED6P86452 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED6P86452 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms