Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CRB1P82279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CRB1P82279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CRB1P82279 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRB1P82279 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRB1P82279 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRB1P82279 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRB1P82279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CRB1P82279 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CRB1P82279 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CRB1P82279 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CRB1P82279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CRB1P82279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CRB1P82279 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CRB1P82279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CRB1P82279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CRB1P82279 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CRB1P82279 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CRB1P82279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CRB1P82279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CRB1P82279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CRB1P82279 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CRB1P82279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CRB1P82279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CRB1P82279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CRB1P82279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CRB1P82279 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CRB1P82279 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CRB1P82279 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CRB1P82279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CRB1P82279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CRB1P82279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CRB1P82279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CRB1P82279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CRB1P82279 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CRB1P82279 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CRB1P82279 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CRB1P82279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CRB1P82279 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CRB1P82279 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CRB1P82279 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CRB1P82279 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CRB1P82279 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CRB1P82279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CRB1P82279 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CRB1P82279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CRB1P82279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CRB1P82279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CRB1P82279 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CRB1P82279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CRB1P82279 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CRB1P82279 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CRB1P82279 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CRB1P82279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CRB1P82279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CRB1P82279 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CRB1P82279 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CRB1P82279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CRB1P82279 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CRB1P82279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CRB1P82279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CRB1P82279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CRB1P82279 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CRB1P82279 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CRB1P82279 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CRB1P82279 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CRB1P82279 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CRB1P82279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CRB1P82279 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CRB1P82279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CRB1P82279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CRB1P82279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CRB1P82279 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CRB1P82279 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CRB1P82279 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CRB1P82279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms