Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT85P78386 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT85P78386 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT85P78386 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT85P78386 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT85P78386 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT85P78386 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT85P78386 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT85P78386 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT85P78386 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT85P78386 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT85P78386 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT85P78386 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT85P78386 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT85P78386 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT85P78386 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT85P78386 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT85P78386 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT85P78386 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT85P78386 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT85P78386 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT85P78386 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT85P78386 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT85P78386 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT85P78386 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT85P78386 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT85P78386 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT85P78386 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT85P78386 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT85P78386 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT85P78386 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT85P78386 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT85P78386 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT85P78386 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT85P78386 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT85P78386 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT85P78386 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT85P78386 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT85P78386 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT85P78386 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT85P78386 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT85P78386 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT85P78386 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms