Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTAG1AP78358 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTAG1AP78358 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTAG1AP78358 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms