Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC5P78333 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC5P78333 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC5P78333 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC5P78333 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC5P78333 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC5P78333 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC5P78333 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC5P78333 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC5P78333 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC5P78333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPC5P78333 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GPC5P78333 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC5P78333 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC5P78333 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC5P78333 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC5P78333 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC5P78333 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC5P78333 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC5P78333 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC5P78333 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC5P78333 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC5P78333 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC5P78333 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC5P78333 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC5P78333 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC5P78333 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC5P78333 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC5P78333 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC5P78333 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC5P78333 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC5P78333 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC5P78333 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC5P78333 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC5P78333 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms