Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM193AP78312 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM193AP78312 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM193AP78312 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms