Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2LP62875 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms