Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOBP62745 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOBP62745 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOBP62745 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOBP62745 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOBP62745 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHOBP62745 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOBP62745 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOBP62745 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOBP62745 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms