Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTBP60709 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTBP60709 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTBP60709 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTBP60709 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTBP60709 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTBP60709 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTBP60709 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTBP60709 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTBP60709 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTBP60709 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTBP60709 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTBP60709 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTBP60709 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTBP60709 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTBP60709 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTBP60709 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTBP60709 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTBP60709 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTBP60709 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTBP60709 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTBP60709 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTBP60709 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTBP60709 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTBP60709 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTBP60709 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTBP60709 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTBP60709 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTBP60709 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms