Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCDC1P59894 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCDC1P59894 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms