Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00315P59091 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00315P59091 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00315P59091 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms