Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX10P56693 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX10P56693 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX10P56693 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX10P56693 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX10P56693 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX10P56693 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX10P56693 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX10P56693 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX10P56693 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX10P56693 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX10P56693 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX10P56693 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX10P56693 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX10P56693 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX10P56693 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX10P56693 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX10P56693 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX10P56693 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOX10P56693 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOX10P56693 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOX10P56693 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOX10P56693 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX10P56693 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX10P56693 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX10P56693 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX10P56693 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOX10P56693 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX10P56693 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX10P56693 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX10P56693 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX10P56693 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX10P56693 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX10P56693 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX10P56693 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX10P56693 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX10P56693 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX10P56693 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX10P56693 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX10P56693 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX10P56693 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX10P56693 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX10P56693 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX10P56693 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX10P56693 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX10P56693 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX10P56693 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX10P56693 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX10P56693 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX10P56693 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX10P56693 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX10P56693 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX10P56693 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX10P56693 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX10P56693 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX10P56693 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX10P56693 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX10P56693 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms