Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC13P55735 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC13P55735 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC13P55735 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC13P55735 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC13P55735 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC13P55735 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC13P55735 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC13P55735 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC13P55735 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC13P55735 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC13P55735 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC13P55735 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms