Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLTPP55058 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLTPP55058 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLTPP55058 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLTPP55058 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLTPP55058 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLTPP55058 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLTPP55058 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLTPP55058 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLTPP55058 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLTPP55058 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLTPP55058 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLTPP55058 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLTPP55058 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLTPP55058 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLTPP55058 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLTPP55058 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLTPP55058 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLTPP55058 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLTPP55058 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLTPP55058 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLTPP55058 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms