Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN1P54253 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN1P54253 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN1P54253 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms