Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRISP3P54108 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms