Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSCP53634 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSCP53634 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSCP53634 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSCP53634 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSCP53634 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSCP53634 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSCP53634 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSCP53634 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSCP53634 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSCP53634 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSCP53634 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSCP53634 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSCP53634 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSCP53634 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSCP53634 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSCP53634 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSCP53634 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSCP53634 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSCP53634 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms