Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKX2-5P52952 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX2-5P52952 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms