Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST1P52848 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST1P52848 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST1P52848 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST1P52848 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST1P52848 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST1P52848 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDST1P52848 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDST1P52848 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NDST1P52848 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST1P52848 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST1P52848 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST1P52848 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST1P52848 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST1P52848 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDST1P52848 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDST1P52848 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST1P52848 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST1P52848 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST1P52848 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDST1P52848 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDST1P52848 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST1P52848 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDST1P52848 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDST1P52848 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDST1P52848 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDST1P52848 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST1P52848 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST1P52848 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST1P52848 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST1P52848 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST1P52848 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDST1P52848 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDST1P52848 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDST1P52848 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDST1P52848 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms