Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HK3P52790 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HK3P52790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HK3P52790 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HK3P52790 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HK3P52790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HK3P52790 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HK3P52790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HK3P52790 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HK3P52790 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HK3P52790 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HK3P52790 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HK3P52790 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HK3P52790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HK3P52790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HK3P52790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HK3P52790 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HK3P52790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HK3P52790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HK3P52790 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HK3P52790 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HK3P52790 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HK3P52790 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HK3P52790 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HK3P52790 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HK3P52790 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HK3P52790 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms