Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF143P52747 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF143P52747 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms