Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGDP52209 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGDP52209 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGDP52209 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGDP52209 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGDP52209 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGDP52209 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGDP52209 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGDP52209 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGDP52209 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGDP52209 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGDP52209 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGDP52209 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PGDP52209 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PGDP52209 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGDP52209 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGDP52209 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGDP52209 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGDP52209 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGDP52209 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGDP52209 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PGDP52209 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGDP52209 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGDP52209 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGDP52209 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGDP52209 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGDP52209 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGDP52209 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGDP52209 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGDP52209 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGDP52209 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms