Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCN2P51788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCN2P51788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms